El sector del cultivo de moluscos bivalvos, y en particular de la almeja, posee gran importancia economica en Galicia. La sobreexplotacion de los bancos naturales, junto con otros factores de indole empresarial, han inducido a la importacion de semilla y ejemplares adultos, con el riesgo consiguiente de introduccion de nuevas patologias (un ejemplo podria ser la aparicion de la enfermedad del anillo marron). Los objetivos principales del presente proyecto (continuacion de los proyectos AGL2003-09307-c02-01, AGL2006-13208-c02-01 y AGL2010-14838) son por un lado, el estudio de la completa diversidad taxonomica y funcional (metagenoma y metatranscriptoma) de la microbiota asociada a la almeja cultivada utilizando tecnicas de secuenciacion masiva. Por otro lado, aquellos microorganismos "no cultivables" que puedan ejercer un papel clave en la biologia del hospedador o en la dinamica de la comunidad bacteriana se intentaran aislar y cultivar mediante medios y tecnicas de cultivo optimizados, para posteriormente caracterizarlos fenotipica- y geneticamente, realizando ensayos de inoculaciones experimentales cuando proceda. Por ultimo, en el caso de taxones "clave" que no puedan ser cultivados mediante las aproximaciones de optimizacion, se procedera a la secuenciacion, ensamblado y anotacion de los genomas de los mismos mediante la tecnica "single-cell sequencing" con el fin de conocer el repertorio genetico que dichos microorganismos presentan, sus potenciales caracteristicas metabolicas/fisiologicas y con ello determinar sus posibles efectos sobre el crecimiento de almeja, ya sea negativo (potencial patogeno) o beneficioso (actividad probiotica). El estudio de la microbiota asociada a poblaciones de almeja y la identificacion de posibles nuevos generos y/o especies bacterianos tiene importancia desde el punto de vista del conocimiento basico, ya que permitira avanzar en el conocimiento de la taxonomia de procariotas de ambientes marinos, especialmente de aquellos que habitualmente no pueden ser cultivadas por procedimientos clasicos. Por otro lado, el estudio de los aislados desde un punto de vista ecologico y funcional tiene asi mismo un caracter de investigacion aplicada ya que, en el caso de microorganismos con potencial patogenico nos permitira conocer la verdadera situacion sanitaria de los cultivos, y profundizar en los factores patobiologicos determinantes del desencadenamiento de las distintas enfermedades. Por ultimo, constituira uno de los primeros estudios en los que se aplicaran los enfoques metagenomico y metatranscriptomico al estudio de la microbiota moluscos en todo el mundo.
Palabras Clave / Keywords
- bacterias no cultivables
- bacterias patógenas
- diversidad bacteriana
- metagenoma
- metatranscriptoma
- probióticos
- secuenciación de celulas únicas
- almeja