La variabilidad genomica es la base sobre la que opera la seleccion. Por ello, es importante conocer los mecanismos que la generan. La variabilidad genomica es el resultado de diferentes procesos que introducen diferentes tipos de mutaciones. Errores en la replicacion del adn, la radiacion uv y la exposicion a algunos productos quimicos dan lugar a polimorfismos de un solo nucleotido (snps) o a pequeñas inserciones/deleciones, mientras que otros procesos, como el movimiento de transposones o su recombinacion, dan lugar a inserciones/deleciones grandes y a reorganizaciones cromosomicas. Otros procesos, tambien relacionados con la actividad de transposones, pueden resultar en la variacion de presencia/ ausencia (pav) de genes. Todas estas mutaciones generan la variabilidad que puede ser seleccionada durante la evolucion, incluyendo la domesticacion y la mejora de plantas. La seleccion afecta diferencialmente la diversidad genomica, ya que se dirige a regiones especificas del genoma que contiene genes que regulan los rasgos seleccionados. La busqueda de regiones de baja variabilidad puede ayudar a identificar los genes especificos o mutaciones que subyacen a los procesos evolutivos. Esta informacion es de gran valor para definir cuales son los genes sobre los que concentrarse en la mejora genetica . La secuenciacion completa de genomas de especies cultivadas, asi como el desarrollo de metodos de resecuenciacion y herramientas bioinformaticas para comparar estos genomas, permite por primera vez un analisis exhaustivo de la variabilidad genomica de las especies cultivadas. Los grupos que presentan esta propuesta lideraron la secuenciacion del genoma del melon y han comenzado a analizar su variabilidad a partir de datos de resecuenciacion de variedades. Tambien han desarrollado herramientas para analizar la variabilidad debido tanto a snps como al movimiento de transposones. En este proyecto se proponen perfeccionar y aplicar estas herramientas para analizar la variabilidad del melon en comparacion con la del pepino y la de especies del genero prunus (principalmente melocoton). Esto deberia arrojar luz sobre aspectos fundamentales de la evolucion del genoma de plantas y de los genes que subyacen a la domesticacion y la mejora del melon. Aunque la informacion sobre la variabilidad del genoma es clave para la identificacion de las variantes genicas responsables de los rasgos seleccionados en la domesticacion y la mejora, para transformar este conocimiento en nuevas variedades comerciales se requiere de buenos metodos para su introduccion selectiva. Cuando la nueva variante genetica no esta disponible en el pool genetico, solo se pueden usar dos estrategias: mutaciones al azar en estrategias como el tilling, y la transgenesis. Sin embargo, ambas tienen limitaciones importantes. Durante los ultimos años, se estan desarrollando nuevas herramientas basadas en el uso de nucleasas especificas (sdns) para la introduccion dirigida de variantes genicas que deberia permitir una nueva generacion de plantas modificadas geneticamente con fenotipos mas predecibles y mas seguras. En este proyecto proponemos (a ) realizar un analisis detallado de la variabilidad generada y seleccionado durante la reciente evolucion de especies cultivadas de particular relevancia, y (b ) iniciar una nueva linea de investigacion en el desarrollo de enfoques basados en sdns para introducir mutaciones especificas en los genomas de plantas cultivadas.