La bilis es un fluido elaborado en el higado y almacenado en la vesicula biliar, desde donde se libera al duodeno durante la digestion de los alimentos. Entre sus constituyentes principales se encuentran las sales biliares y el colesterol. En condiciones fisiologicas normales, las sales biliares actuan como detergentes biologicos y solubilizan los compuestos lipofilicos en el intestino, favoreciendo asi la digestion de grasas procedentes de la dieta. Sin embargo, se han descrito algunos trastornos biliares que dificultan ciertas funciones fisiologicas del organismo, siendo el mas habitual la formacion de calculos biliares o litiasis. La microbiota del sistema gastrointestinal humano y su relacion con diferentes estados fisiologicos (dieta, edad, trastornos metabolicos, etc.) Ha sido objeto de numerosos estudios de gran impacto cientifico durante la ultima decada. Asi, las poblaciones microbianas del estomago e intestino han sido caracterizadas con detalle. Sin embargo, la microbiota de la bilis y de la vesicula biliar apenas ha sido estudiada hasta el momento, debido fundamentalmente a las dificultades existentes para acceder a material biologico y a la falta de tecnicas moleculares adecuadas. Ademas, las funciones de los microorganismos autoctonos de la bilis y las caracteristicas que les permiten sobrevivir y colonizar el ambiente biliar no han sido investigadas. Estas funciones han de ser, necesariamente, el reflejo de una fisiologia microbiana adaptada a un ambiente muy singular. En este contexto, con el presente proyecto queremos abordar un estudio que contribuya a entender las funciones de la microbiota biliar humana y a determinar su relacion con la dieta y con algunos trastornos biliares. Pretendemos caracterizar nuevos biomarcadores de litiasis y enzimas con potencial aplicacion biomedica y biotecnologica. Para ello, utilizando tecnicas metaproteomicas y de secuenciacion masiva de adn, se determinaran los perfiles de la microbiota biliar de individuos con y sin litiasis, asi como los perfiles microbianos de calculos biliares y de biopsias de la vesicula biliar. Se estableceran correlaciones entre el metaboloma de las muestras de bilis y la microbiota, la dieta y las diferentes condiciones fisiologicas estudiadas. Generaremos tambien una coleccion de microorganismos del ambiente biliar y los mas representativos seran caracterizados mediante genomica funcional. Ademas, pretendemos descubrir nuevas actividades bacterianas capaces de interferir en la formacion de calculos biliares o de disgregarlos. Por ultimo, una aproximacion transcriptomica nos permitira esclarecer los mecanismos de cross-talk entre ciertos microorganismos seleccionados y algunos factores del ambiente biliar.