La mayoria de las vacunas comerciales deberian ser consideradas como 'imperfectas' desde un punto de vista virologico, puesto que no proporcionan una proteccion total de la infeccion por el patogeno pero son capaces de conferir una proteccion a los individuos y a las poblaciones de la manifestacion de la enfermedad. Tales vacunas 'no esterilizantes' son ampliamente utilizadas en la actualidad frente al circovirus porcino tipo 2 (pcv2) asi como frente a otros virus, y estas pueden afectar la seleccion de variantes virales in vivo. Efectivamente, la infeccion por pcv2 en un animal determinado en un tiempo determinado se comporta como una cuasiespecie viral sobre la que la seleccion puede actuar. Tambien se ha observado que los anticuerpos generados despues de una infeccion natural son distintos de los generados tras la vacunacion. Por lo tanto, el principal objetivo de este proyecto es determinar la variacion molecular del pcv2 en relacion con la vacunacion mediante el empleo de la secuenciacion de nueva generacion (ngs). Esta tecnologia de secuenciacion masiva nos permitira la identificacion de variantes geneticos (incluidos variantes raros), que podrian pasar desapercibidos en una secuenciacion convencional (secuenciacion de sanger). Nuestros resultados preliminares utilizando ngs han mostrado que diferentes variantes de pcv2 estan co-circulando dentro de granjas en la region nordeste de España. Dados estos resultados, se realizara un estudio para analizar en profundidad la variabilidad genetica del pcv2 durante la vacunacion en el campo asi como en infecciones experimentales. Asi mismo, se evaluara la capacidad del pcv2 de mutar y escapar a la respuesta inmune mediante ensayos de neutralizacion cruzada en infecciones in vitro. Los resultados obtenidos proporcionaran una vision de la evolucion del pcv2 en escenarios sometidos a vacunacion y su posible evolucion hacia la aparicion de mutantes de escape vacunales. Ademas, disponer de una coleccion de posibles cepas de campo que puedan ser consideradas escapes vacunales permitira su caracterizacion y su aislamiento. Este proyecto permitira establecer una vigilancia molecular de los virus, un aspecto que normalmente no se incluye en la investigacion en el campo de las vacunas, y la obtencion de una coleccion de mutantes de escape a la vacuna muy valiosa para estudios posteriores. Los resultados esperados son de gran relevancia para productores y compañias farmaceuticas, su importancia queda reflejada en las cartas de interes aportadas para este proyecto. Por otro lado, la presente aproximacion puede ser aplicada a otros virus para los cuales se utilizan actualmente vacunas consideradas no optimas.