El tomate (Solanum lycopersicum l.) Constituye la especie de mayor relevancia entre las horticolas, gracias en parte a sus propiedades nutricionales y al conocimiento agronomico y genetico adquirido en las ultimas decadas, que la ha convertido en una especie modelo. Aun cuando se considera con cierta tolerancia a estreses abioticos, las variedades comerciales son susceptibles a plagas y enfermedades debido a la disminucion de variabilidad genetica como resultado de la domesticacion y las posteriores practicas intensivas de seleccion. Para introducir caracteres de resistencia a patogenos en los cultivares susceptibles es necesario recurrir a especies silvestres emparentadas, tales como s. Pimpinellifolium o s. Peruvianum. Por el contrario, no se han conseguido introgresar genes de resistencia a plagas, entre las que destaca la araña roja (tetranychus urticae koch), por ser este un acaro muy polifago que ocasionan perdidas del rendimiento o de cosechas enteras, bastando para ello la infeccion de un tercio de las hojas de una planta de tomate. Recientemente, hemos demostrado que una entrada de s. Pimpinellifolium es resistente a la araña roja porque presenta tricomas glandulares del tipo iv y que la herencia de la resistencia es debida a dos regiones genomicas, o qtls, localizados en el cromosoma 2. Mediante una estrategia de genes candidatos y silenciamiento genico de los mismos, hemos identificado a los genes sl-mixta y sl-glabra (sl-gl), implicados en la formacion de tricomas glandulares y por tanto, en la herencia de la resistencia. En este proyecto proponemos caracterizar en detalle los cambios en la expresion genica promovidos por la alteracion de la expresion de los genes sl-mixta y sl-gl. Para ello vamos a generar plantas transgenicas y cisgenicas y analizaremos cambios en el transcriptoma de esas plantas. Con este fin, es esencial la coordinacion que proponemos con el grupo de la universidad de granada (ugr), expertos bioinformaticos que desarrollaran todas las herramientas de analisis de la ingente cantidad de datos genomicos que se obtienen en este tipo de experimentos. Los genes que el grupo de la ugr determine que podrian estar implicados en la formacion de tricomas o en la sintesis de exudados glandulares de los mismos seran caracterizados en detalle. Para identificar estos genes haremos uso de los datos transcriptomicos, asi como de 4 lineas de plantas transgenicas generados con una 'trampa de intensificadores' y en las que se ha comprobado que muestran expresion especifica del gen delator gus en tricomas glandulares de tomate. Por ultimo, proponemos realizar un programa de mejora genetica de una variedad tradicional mediante la introgression de los qtls de resistencia a araña roja en un programa de retrocruzamiento asistido por seleccion genotipica. Un aspecto innovador de este proyecto reside en el estudio que realizaremos de que cambios ocurren en el trancriptoma, el genoma y el epigenoma de las plantas durante el programa de retrocruzamiento. Para lo que resulta imprescindible la puesta a punto de las herramientas bioinformaticas a desarrollar por el grupo de la ugr. De esa forma identificaremos no solo los genes implicados (marcadores) sino las modificaciones en el genoma de los mismos (epigenoma y epimarcadores) requeridas para la formacion de tricomas glandulares y con ellos para conferir resistencia a araña roja en tomate.
Palabras Clave / Keywords
- araña roja
- epigenómica
- genómica
- mejora genética
- resistencia a plagas
- transcriptómica
- tricomas
- tomate