El sindrome Asia (Autoimmune/Inflamatory Syndrome Induced by Adjuvants) es un proceso de reciente descripcion en el ovino y de patogenia compleja que es similar en muchos aspectos al descrito previamente para los seres humanos. Este sindrome es muy complejo, implica la actuacion de procesos autoinmunes ligados a hiperestimulacion del sistema defensivo organico y se desconocen la mayoria de los factores que lo desencadenan. Ademas, en este proyecto se pretende estudiar la interaccion del proceso con la lentivirosis ovina causada por el virus del visna/maedi, mediante un experimento especifico que incluya animales afectados por la forma artritica. Para la caracterizacion de este sindrome, se proponen dos aproximaciones desde la transcriptomica, mediante la cual se pueden catalogar todas las especies de transcritos, incluyendo mrnas y rnas pequeños y cuantificar los niveles de expresion de cada transcrito. Entre las tecnologias desarrolladas para el analisis del transcriptoma se ha seleccionado la secuenciacion de rna (RNAseq) que se presenta como una tecnica revolucionaria con (dos) varias ventajas basicas respecto a tecnologias previamente utilizadas. No se limita a detectar transcritos que correspondan a secuencias genomicas preexistentes, lo que le hace particularmente atractiva para su utilizacion en organismos no-modelo cuya secuencia no esta completamente terminada, como es el caso de la oveja, y ademas presenta un gran rango dinamico de niveles de expresion, lo que permite detectar expresion a niveles muy bajos o muy altos. Ademas del analisis de la expresion genica global mediante RNAseq, se propone el analisis de micrornas (mirnas), importantantes reguladores de la expresion genica y con un papel preponderante en la regulacion de la inmunidad adaptativa e innata. Aunque se han descrito cerca de 2000 mirnas en ovino, la mayor parte se han detectado en musculo y se desconoce cuales se expresan en celulas del sistema inmune como macrofagos, informacion necesaria para comprender los procesos autoinmunes subyacentes al sindrome Asia. Por ultimo, se propone un analisis integrado de expresion genica y de mirnas. Uno de los pasos esenciales para el entendimiento de la funcion reguladora de los mirna es la identificacion de sus genes diana. Hasta ahora, esta prediccion se hacia mediante tecnicas computacionales basadas en la secuencia, con un alto porcentaje de falsos positivos. Mediante un analisis integrativo en el que se analicen mrnas y micrornas en las mismas muestras, se puede perfilar directamente el nivel de expresion. La correlacion negativa significativa indicaria parejas de dianas.