Las tecnologías de secuenciación masiva han permitido profundizar en el conocimiento sobre los mecanismos que median las interacciones de las bacterias con las plantas, y muy especialmente de aquellas que son fitopatógenas. En los últimos años estas técnicas han contribuido además a descubrir los componentes de la microbiota vegetal y el efecto de ésta sobre los cultivos, identificando dentro de la misma, en ocasiones, bacterias no patógenas taxonómicamente muy cercanas a cepas que causan enfermedad. El grupo de Bacteriología en el INIA/CSIC ha utilizado estas tecnologías para desentrañar diversos aspectos de la patogenicidad y virulencia de bacterias mediante análisis de genómica y transcriptómica comparativas, y además, ha realizado estudios sobre la microbiota presente en diversos sistemas, incluyendo plantas o insectos vectores transmisores de bacterias.

Nuestra vocación es la investigación aplicada sustentada por un trabajo básico previo, y así por ejemplo, nuestros estudios de genómica han servido para el diseño de estrategias de detección de patógenos y diagnóstico de enfermedades importantes para la agricultura europea.